已经是两百四十三岁高龄的爱德华·马格瑞姆（达斯汀·霍夫曼饰）是个豁达乐观、不知何谓仇事的老头，身体健康行事活泼的他如今依然津津乐道地经营着自己一家别具一格的玩具店。马格瑞姆玩具店里的玩具在外形上大多虽与通常孩子们常常看到的玩具相差无几，但这里的每一件玩具却都有着不可思议的魔法力量。但是，有个前提，来着里光顾的顾客和孩子们要想看到神奇玩具的魔法，就必须在心理上相信魔法的存在以及魔法玩具的存在。因此，这样的神奇之处也就更增加了马格瑞姆神奇玩具店的魅力。如今，已经经营玩具店多年的老马格瑞姆打算告别店长的忙碌职位，早日退休好过更加轻松的生活。于是，找个可靠的人来代替自己便成了当前的要事。
　　身材娇小、性格单纯的玩具店店员茉莉·玛哈妮（娜塔丽·波曼饰）虽行事糊涂易犯小错，但心地善良的她却被已然被玩具店老板看好是最适合的接班人。小茉莉继承神奇玩具店后，精心地打理着店里的一切，恐怕自己的疏漏辜负了老马格瑞姆先生的期望。
　　但是，当能力非凡身份神秘的小男孩儿艾瑞克·艾波姆（扎克瑞·米尔斯饰）以及一个没有信仰的年轻会计师亨利（詹森·贝特曼饰）的出现，渐渐改变了可爱的茉莉的店主的生活。玩具店中各式各样的魔法玩具也似乎与茉莉眼中未来美好的生活一般愈发散发出魔幻的气息…